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武汉植物园在莲基因信息分析中取得新进展

武汉植物园在莲基因信息分析中取得新进展

  莲作为莲科莲属多年生草本水生植物,是我国重要的水生经济作物。自中国科学院武汉植物园公布了“中国古代莲”基因组框架图谱以来,对于莲基因组信息的后续研究便大量开展。单核苷酸多态性(SNP幸运28)作为新的遗传标记对基因定位及相关育种研究的意义非常重大。选择性剪切(alternative splicing)作为一个基因编码出不同转录本和蛋白质的重要途径,对满足生物体所需蛋白多样性具有重要意义。因此开展莲基因组中的单核苷酸多态性和基因的选择性剪切的研究,不仅对于进一步完善莲基因组信息具有重要意义,也将极大的促进莲的分子育种以及莲的其他分子生物学方面的研究。

  武汉植物园幸运28水生植物基因组学与遗传育种(原资源植物繁殖生物学)学科组副研究员杨美在研究员杨平仿的指导下,利用该园获得的莲基因组及相关转录组数据,深入分析了4种亚洲莲的单核苷酸多态性和选择性剪切,相关研究结果已整理成文,在线发表在PLOS ONE幸运28

  文章链接 

 

  四种亚洲莲SNP的数目及类型。A. 四种亚洲莲SNP分布的韦恩图;B. SNP数目在该研究(I)与前期研究(II)的比较;C. 四种亚洲莲SNP类型比较。